维生素B2在动物机体代谢过程中起着重要作用。磷酸核黄素(又叫黄素单核苷酸)和黄素腺嘌呤二核苷酸是机体内的两种重要辅酶。维生素B2是构成这两种辅酶的主要成分。在动物的所有组织中，都存在这两种辅酶，这些酶大部分与蛋白质结合成各种黄酶，参与体内的生物氧化过程。维生素B2在碳水化合物和蛋白质的氧化、代谢过程中，起着传递氢的作用。