一旦发现脱肛鸡，应立即进行隔离，重症鸡大都愈后不良，没有治疗价值，所以宜及早作淘汰处理。
对症状较轻的患鸡，可用1%的高锰酸钾溶液或3%明矾水(38℃)将脱出部位洗净，随后热敷，并用手将脱出部位送入泄殖腔内，然后涂上紫药水，撒敷消炎粉或土霉素粉，以防继发感染。
症状较重的患鸡，除采取上述方法外，还可酌情做烟包式缝合。缝合前，必须先取出留在泄殖腔中的蛋，缝合处留出排粪孔。
治疗期间，需实行限饲或停饲，使之停产并减少排粪，同时加强饲养管理，保持环境安静、干燥、温暖，供应充足、清洁饮水。
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