从口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)感染康复牛的舌皮组织中克隆到了β6亚基基因并对其核苷酸序列和推导的氨基酸进行了比较分析。
牛β6基因的编码区含有2367个核苷酸,编码788个氨基酸残基,其中信号肽由26个氨基酸组成(1~26aa);胞外域由681个氨基酸组成,含有10个潜在的糖基化位点(NXT/NXS)和51个半胱氨酸(Cys)残基;跨膜区由29个氨基酸组成(708~736aa);胞浆域由52个氨基酸组成,含有1个NPLY核心基序,该基因在GenBank中的登录号为DQ867017。牛β6基因与羊、猪、人、小鼠、挪威大鼠β6基因的核苷酸序列同源性分别为97.0%、91.6%、88.6%、82.5%和82.7%,推导的氨基酸序列同源性分别为97.1%、93.7%、93.0%、89.2%和89.2%。
口蹄疫病毒自然宿主(牛、羊、猪)的β6亲缘关系较近,提示β6亚基可能与口蹄疫病毒的宿主范围有关。
